Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms