Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms