Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLR2AP24928 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms