Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERCC3P19447 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms