Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAV1P15498 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAV1P15498 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAV1P15498 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms