Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms