Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms