Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF1P10914 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF1P10914 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF1P10914 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms