Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRGAP2CP0DJJ0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRGAP2CP0DJJ0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms