Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC2P02655 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOC2P02655 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC2P02655 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC2P02655 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC2P02655 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms