Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1RP00736 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1RP00736 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1RP00736 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms