Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLGNO14967 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLGNO14967 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLGNO14967 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLGNO14967 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLGNO14967 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLGNO14967 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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