Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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