Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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