Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RGPD3A6NKT7 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms