Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA6BA6NDN3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.3 ms