Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
A4D1N5 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
A4D1N5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
A4D1N5 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
A4D1N5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
A4D1N5 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
A4D1N5 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
A4D1N5 LMOD3-203ENST00000489031 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
A4D1N5 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
A4D1N5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
A4D1N5 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
A4D1N5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms