Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms