Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms