Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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