Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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