Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC17A6Q9P2U8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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