Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRBP1Q9P2E9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms