Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms