Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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