Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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C9orf85Q96MD7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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C9orf85Q96MD7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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C9orf85Q96MD7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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