Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LTV1Q96GA3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTV1Q96GA3 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms