Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms