Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3CQ92520 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms