Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATAD1Q8NBU5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATAD1Q8NBU5 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.6 ms