Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4BQ8N7F7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms