Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms