Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CATSPER4Q7RTX7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms