Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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TCF23Q7RTU1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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TCF23Q7RTU1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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TCF23Q7RTU1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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TCF23Q7RTU1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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TCF23Q7RTU1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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TCF23Q7RTU1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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TCF23Q7RTU1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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TCF23Q7RTU1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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TCF23Q7RTU1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TCF23Q7RTU1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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