Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC19Q6DKK2 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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