Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms