Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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