Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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CDO1Q16878 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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