Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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