Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK5Q16478 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK5Q16478 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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