Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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GABRA6Q16445 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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GABRA6Q16445 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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GABRA6Q16445 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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GABRA6Q16445 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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GABRA6Q16445 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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GABRA6Q16445 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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