Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms