Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NCF4Q15080 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms