Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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