Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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