Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms