Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMC2Q13753 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms