Protein–RNA interactions for Protein: Q13642

FHL1, Four and a half LIM domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL1Q13642 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL1Q13642 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL1Q13642 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms