Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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