Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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